水灾不仅造成严重的经济损失及生命安全威胁，水灾过后还极易伴随疫情发生。由于气温较高，细菌繁殖加快，苍蝇、蚊子滋生多、密度高，加之水源等污染严重，食品容易腐败变质，人员接触疫水机会增多，生活环境条件下降，等等，导致人体抗病能力下降，容易患病，特别是一些肠道传染病，包括痢疾、伤寒、霍乱、甲型肝炎及食物中毒等；其次是虫媒传染病，如疟疾、乙型脑炎等；以及一些经体表感染传播的疾病如钩端螺旋体等。因此，水灾过后，受灾地区要特别注意做好各方面的卫生和消毒工作，加强自我保护。
洪水灾区防疫消毒剂可能需要消毒对象为：
1、水消毒：可用1mg/L有效氯的双剑牌二氧化氯消毒剂消毒作用30分钟。（尽量创造条件喝开水）。对于井水，污染的水井应先将水井清淘干净，用清水冲洗井壁和井底，淘净污水，直到渗出的进水达到无色透明、无味为止。再加25-50mg/Ｌ的双剑牌二氧化氯消毒剂，浸泡4小时后，抽出井水，待自然渗出水到正常水位时，按正常消毒方法加1mg/L的双剑牌二氧化氯消毒剂进行消毒。
2、 环境消毒：对发现或挖掘出尸体的地方应进行消毒；对有粪便外溢的地方应进行消毒。可用含有效氯2000mg/L的双剑牌消毒剂溶液喷洒消毒，用量为300—500ml/m3。
3、 尸体消毒：动物尸体一经发现立即深埋或焚烧，并应向死亡动物周围喷撒漂白粉。动物尸体可用含有效氯500mg/L的双剑牌消毒剂溶喷洒消毒，以表面湿润为宜。尸体应尽快火化，土葬时应远离水源50米以上，棺木应在距地面2米以下深埋，棺内尸体两侧及底部铺垫厚达3cm—5cm漂白粉，棺外底部铺垫厚3cm—5cm漂白粉。
4、 运输工具的消毒：运输尸体的车辆内表面可用含有效氯200mg/L（稀释100倍的水）双剑牌消毒剂进行冲洗。
5、灾民安置点的消毒：用含有效氯1000mg/L（稀释20倍的水）的双剑牌消毒剂进喷雾消毒
6、 餐（饮）具：用50mg/L（稀释400倍的水）的双剑牌消毒剂进行浸泡作用15分钟
7、 外环境地面：用含有效氯100mg/L（稀释200倍的水）的双剑牌消毒剂进冲洗消毒，作用时间应不少于30分钟,量为300—500毫升/平方米。
8、（临时）厕所地面：厕所的四壁和地面要消毒。用含有效氯600mg/L的双剑牌消毒剂溶液喷洒消毒。
9、粪便：灾民安置点的粪便要集中收集，就地进行消毒。以活化后双剑牌消毒剂原液加入，加入消毒剂约为1：100，适当搅匀。